Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms