Protein–RNA interactions for Protein: Q96SA4

SERINC2, Serine incorporator 2, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC2Q96SA4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERINC2Q96SA4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SERINC2Q96SA4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SERINC2Q96SA4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SERINC2Q96SA4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SERINC2Q96SA4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERINC2Q96SA4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERINC2Q96SA4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SERINC2Q96SA4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SERINC2Q96SA4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERINC2Q96SA4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SERINC2Q96SA4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERINC2Q96SA4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SERINC2Q96SA4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SERINC2Q96SA4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SERINC2Q96SA4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERINC2Q96SA4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERINC2Q96SA4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SERINC2Q96SA4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SERINC2Q96SA4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SERINC2Q96SA4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SERINC2Q96SA4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERINC2Q96SA4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERINC2Q96SA4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms