Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CSRNP1Q96S65 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CSRNP1Q96S65 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSRNP1Q96S65 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSRNP1Q96S65 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSRNP1Q96S65 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSRNP1Q96S65 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSRNP1Q96S65 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSRNP1Q96S65 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSRNP1Q96S65 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSRNP1Q96S65 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CSRNP1Q96S65 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CSRNP1Q96S65 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CSRNP1Q96S65 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CSRNP1Q96S65 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CSRNP1Q96S65 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSRNP1Q96S65 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms