Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TEFMQ96QE5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms