Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALS2CR12Q96Q35 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms