Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC85AQ96PX6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms