Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIC6Q96NY7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms