Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms