Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU6

ZNF778, Zinc finger protein 778, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF778Q96MU6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF778Q96MU6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF778Q96MU6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF778Q96MU6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF778Q96MU6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF778Q96MU6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF778Q96MU6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF778Q96MU6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF778Q96MU6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF778Q96MU6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF778Q96MU6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF778Q96MU6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF778Q96MU6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF778Q96MU6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF778Q96MU6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF778Q96MU6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF778Q96MU6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF778Q96MU6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF778Q96MU6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF778Q96MU6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF778Q96MU6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF778Q96MU6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF778Q96MU6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF778Q96MU6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF778Q96MU6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF778Q96MU6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF778Q96MU6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF778Q96MU6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF778Q96MU6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF778Q96MU6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF778Q96MU6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF778Q96MU6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF778Q96MU6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF778Q96MU6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms