Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT1

RNF145, RING finger protein 145, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF145Q96MT1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF145Q96MT1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF145Q96MT1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms