Protein–RNA interactions for Protein: Q96MS0

ROBO3, Roundabout homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO3Q96MS0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ROBO3Q96MS0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.5 ms