Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms