Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms