Protein–RNA interactions for Protein: Q96KK3

KCNS1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1Q96KK3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS1Q96KK3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNS1Q96KK3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms