Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF7

SMIM8, Small integral membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM8Q96KF7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM8Q96KF7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms