Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS50Q96JG6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms