Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
SLC35A4Q96G79 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC35A4Q96G79 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms