Protein–RNA interactions for Protein: Q96G23

CERS2, Ceramide synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS2Q96G23 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CERS2Q96G23 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CERS2Q96G23 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CERS2Q96G23 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CERS2Q96G23 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CERS2Q96G23 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CERS2Q96G23 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CERS2Q96G23 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CERS2Q96G23 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CERS2Q96G23 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CERS2Q96G23 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CERS2Q96G23 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CERS2Q96G23 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CERS2Q96G23 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CERS2Q96G23 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CERS2Q96G23 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CERS2Q96G23 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CERS2Q96G23 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CERS2Q96G23 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CERS2Q96G23 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CERS2Q96G23 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CERS2Q96G23 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms