Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFSD3Q96ES6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms