Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM44Q96DX7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM44Q96DX7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms