Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC39Q96DD0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC39Q96DD0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms