Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms