Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC127Q96BQ5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC127Q96BQ5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms