Protein–RNA interactions for Protein: Q96A05

ATP6V1E2, V-type proton ATPase subunit E 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E2Q96A05 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms