Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HDAC10Q969S8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms