Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NEIL2Q969S2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NEIL2Q969S2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NEIL2Q969S2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms