Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HPS3Q969F9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms