Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms