Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms