Protein–RNA interactions for Protein: Q92618

ZNF516, Zinc finger protein 516, humanhuman

Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF516Q92618 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF516Q92618 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF516Q92618 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF516Q92618 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF516Q92618 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF516Q92618 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF516Q92618 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF516Q92618 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF516Q92618 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF516Q92618 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF516Q92618 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF516Q92618 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms