Protein–RNA interactions for Protein: Q92560

BAP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BAP1Q92560 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BAP1Q92560 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BAP1Q92560 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BAP1Q92560 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BAP1Q92560 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BAP1Q92560 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BAP1Q92560 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BAP1Q92560 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BAP1Q92560 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BAP1Q92560 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BAP1Q92560 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BAP1Q92560 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BAP1Q92560 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BAP1Q92560 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BAP1Q92560 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BAP1Q92560 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BAP1Q92560 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BAP1Q92560 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BAP1Q92560 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BAP1Q92560 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BAP1Q92560 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BAP1Q92560 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BAP1Q92560 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BAP1Q92560 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BAP1Q92560 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BAP1Q92560 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BAP1Q92560 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BAP1Q92560 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BAP1Q92560 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BAP1Q92560 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BAP1Q92560 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BAP1Q92560 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BAP1Q92560 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BAP1Q92560 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BAP1Q92560 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BAP1Q92560 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms