Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCSTNQ92542 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCSTNQ92542 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms