Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.42
CTTNBP2Q8WZ74 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms