Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASKIN2Q8WXE0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASKIN2Q8WXE0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms