Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA9

SREK1, Splicing regulatory glutamine/lysine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREK1Q8WXA9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SREK1Q8WXA9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SREK1Q8WXA9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SREK1Q8WXA9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SREK1Q8WXA9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SREK1Q8WXA9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SREK1Q8WXA9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SREK1Q8WXA9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SREK1Q8WXA9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms