Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC12Q8WVT3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189 ms