Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU0

DDI1, Protein DDI1 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDI1Q8WTU0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDI1Q8WTU0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDI1Q8WTU0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms