Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH3RF3Q8TEJ3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH3RF3Q8TEJ3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms