Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SSH3Q8TE77 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSH3Q8TE77 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms