Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRSK1Q8TDC3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms