Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCT6

SPPL3, Signal peptide peptidase-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPPL3Q8TCT6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPPL3Q8TCT6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPPL3Q8TCT6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SPPL3Q8TCT6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPPL3Q8TCT6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPPL3Q8TCT6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPPL3Q8TCT6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPPL3Q8TCT6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPPL3Q8TCT6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPPL3Q8TCT6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPPL3Q8TCT6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPPL3Q8TCT6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPPL3Q8TCT6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPPL3Q8TCT6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPPL3Q8TCT6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPPL3Q8TCT6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPPL3Q8TCT6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPPL3Q8TCT6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPPL3Q8TCT6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPPL3Q8TCT6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPPL3Q8TCT6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPPL3Q8TCT6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPPL3Q8TCT6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPPL3Q8TCT6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPPL3Q8TCT6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPPL3Q8TCT6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPPL3Q8TCT6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPPL3Q8TCT6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPPL3Q8TCT6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPPL3Q8TCT6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPPL3Q8TCT6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPPL3Q8TCT6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPPL3Q8TCT6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPPL3Q8TCT6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPPL3Q8TCT6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms