Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
TTLL11Q8NHH1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TTLL11Q8NHH1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms