Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HELBQ8NG08 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HELBQ8NG08 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms