Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms