Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBP5

MFSD9, Major facilitator superfamily domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD9Q8NBP5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD9Q8NBP5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD9Q8NBP5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD9Q8NBP5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD9Q8NBP5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD9Q8NBP5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD9Q8NBP5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD9Q8NBP5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD9Q8NBP5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD9Q8NBP5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD9Q8NBP5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD9Q8NBP5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD9Q8NBP5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD9Q8NBP5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD9Q8NBP5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD9Q8NBP5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD9Q8NBP5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD9Q8NBP5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD9Q8NBP5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD9Q8NBP5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD9Q8NBP5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD9Q8NBP5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD9Q8NBP5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD9Q8NBP5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD9Q8NBP5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD9Q8NBP5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD9Q8NBP5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD9Q8NBP5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD9Q8NBP5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD9Q8NBP5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MFSD9Q8NBP5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms