Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM229BQ8NBD8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms