Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAB2

KBTBD3, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD3Q8NAB2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KBTBD3Q8NAB2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
KBTBD3Q8NAB2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KBTBD3Q8NAB2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KBTBD3Q8NAB2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KBTBD3Q8NAB2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
KBTBD3Q8NAB2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KBTBD3Q8NAB2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KBTBD3Q8NAB2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KBTBD3Q8NAB2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms