Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG16L2Q8NAA4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG16L2Q8NAA4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms