Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
AMER3Q8N944 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms