Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8W4

PNPLA1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA1Q8N8W4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms